- Jasan tekst M proizvoljne duljine
- Tajni ključ K duljine 128 ili 256 bita (128 bita za Deoxys-II-128)
- Pridruženi podaci AD duljine proizvoljne duljine (128 bita za Deoxys-II-128)
- Javni broj poruke N (nonce) duljine 120 bita
Izlazni podatci funkcije za enkripciju Deoxys su:
- Šifrirana poruka C duljine |M| bita
- Autentifikacijska oznaka T duljine |T| bita (preporuka |T| = 128 bita)